Η ΑΕ Κυδωνίας επικράτησε μετά από ένα δραματικό τελικό του Ν.Κισσαμικού με 7-6 στα πέναλτι (2-2 κ.α., 3-3 παρ.) και κατέκτησε για πρώτη φορά στην 25χρονη ιστορία της το Κύπελλο Χανίων

Μεγάλες συγκινήσεις επιφύλασσε ο 52ος τελικός του Κυπέλλου Χανίων, με την ΑΕ Κυδωνίας μετά από αγώνα θρίλερ να κερδίζει στη διαδικασία των πέναλτι με 7-6 στα πέναλτι (2-2 κ.α., 3-3 παρ.) τον Ν.Κισσαμικό. Η ομάδα των Μουσούρων κατέκτησε έτσι για πρώτη φορά στην 25χρονη  ιστορία της το τρόπαιο που είναι επίσης και ο πρώτος της τίτλος.

Παράλληλα οι ερυθρόλευκοι έγιναν η 23η ομάδα που κατακτά το Κύπελλο στα Χανιά. Η χρονιά ίδρυσης της ΑΕ Κυδωνίας, 1999,  ήταν και η πρώτη και τελευταία μέχρι σήμερα χρονιά που ο Κισσαμικός κατέκτησε το τρόπαιο χάνοντας απόψε την ευκαιρία να ντουμπλάρει τις επιτυχίες του. Αυτός ήταν ο έκτος χαμένος τελικός για την ομάδα από το Καστέλι.

Οι τελικοί του Κυπέλλου
1972: Παγχανιακός-Μινώταυρος 2-0
1973: Ιδομενέας-Παγχανιακός 8-7 πέν. (2-2 κ.α και παρ.)
1974: Αναγέννηση-Ιδομενέας 2-1
1975: Ιωνία-Μινώταυρος 3-2 παρ.
1976: Ιωνία-Μινώταυρος 4-0
1977: Ιωνία –Παγχανιακός 2-0
1978: Ιδομενέας-Ιωνία 1-0
1979: Κρ. Αστέρας -Κισαμικός 3-2 παρ. (1-1 κ.α.)
1980: Κρ. Αστέρας -Άρης Σ. 2-0
1981: ΑΟΧ-Ιωνία 3-1
1982: Ιωνία-Πλατανιάς 1-0 παρ.
1983: Ιωνία-Άρης Σ, 3-0
1984: Ιωνία-Μινώταυρος 2-1 παρ. (1-1 κ.α.)
1985: Μινώταυρος-Θύελλα Ακρ. 4-2 πεν. (0-0 κ.α. και παρ.)
1986: Μινώταυρος-Κισαμικός 2-0
1987: Πλατανιάς-Μινώταυρος 5-2 πεν. (1-1κ.α. και παρ.)
1988: Μινώταυρος-Θησέας 3-0
1989: ΑΟΧ-Ίκαρος Μ. 3-0
1990: Πλατανιάς-ΑΟΧ 2-1 παρ. (1-1 κ.α.)
1991: Ιωνία-Θησέας 2-0
1992: ΑΟΧ-Μινώταυρος 5-0
1993: Ιωνία-ΑΟΧ 6-5 πεν (2-2 κ.α. 3-3 παρ.)
1994: Πλατανιάς-Παγχανιακός 2-1
1995: Ιωνία –Πλατανιάς 2-0
1996: Ίκαρος Μ. –Μινώταυρος 2-0
1997: Ιωνία- Κισαμικός 4-1
1998: ΑΕΧ-Μινώταυρος 5-1
1999: Κισαμικός-ΑΟΧ / Παγχανιακός 6-5πεν. (1-1 κ.α και 2-2 παρ.)
2000: ΑΕΧ-Ιωνία 2000 6-1
2001: ΑΕΧ-Θησέας 5-2
2002: Άρης Σ.- Παλαιόχωρα 4-0
2003: Πλατανιάς-Κορωνίδα 3-0
2004: Θησέας-Πλατανιάς 3-1
2005: Μινώταυρος-Πανακρωτηριακός 2-1 παρ. (1-1 κ.α.)
2006: Πλατανιάς-Παγχανιακός 4-0
2007: ΑΟ Χανιά-Πλατανιάς 2-0
2008: ΑΟ Χανιά – Μινώταυρος 1-0
2009: Πλατανιάς-ΑΟΧ 6-5 πέν. (0-0 κ.α. και παρ.)
2010: ΑΟΧ-Ακρίτας 2-1
2011: Ακρίτας-Κισσαμικός 2-1
2012: Μινώταυρος-Ιωνία 2000 3-0
2013: Ιωνία 2000-Κισσαμικός 1-0
2014: Σπάθα–Μινώταυρος 3-1
2015: Αρης Βουκολιών–Αρης Σούδας 2-1
2016: Αρης Βουκολιών-Αρης Σούδας 4-3 πεν. (0-0 κ.α. και παρ.)
2017: Πλατανιάς-Πανακρωτηριακός 8-7 πεν. (1-1 κ.α. και παρ., 7-6 πέν.)
2018: Παλαιόχωρα-ΣΥΝΚΑ 2-1
2019: ΣΥΝΚΑ-Απόλλων 1-0
2020: Πανακρωτηριακός-Μινώταυρος (Δεν διεξήχθη λόγω κορωνοϊού – Κυπελλούχος ο Πανακρωτηριακός μετά από κλήρωση)
2021: Δεν διεξήχθη λόγω κορωνοϊού
2022: Απόλλων-Ηφαιστος 4-0
2023: Απόλλων-Γρανίτης 0-2
2024: ΑΕ Κυδωνίας-Ν.Κισσαμικός 7-6 πέν. (2-2 κ.α., 3-3 παρ.)

Η βίβλος του Κυπέλλου Χανίων 

Η Ιωνία έχει κατακτήσει το Κύπελλο Χανίων 10 φορές συνεπώς είναι και ο πολυνίκης του θεσμού. Αξίζει βέβαια να αναφερθεί ότι επί της ουσίας η ίδια ομάδα έχει ακόμα και μία κατάκτηση ως Αναγέννηση και μία ως Ιωνία 2000.

Ιωνία 10 τρόπαια
Πλατανιάς 7
ΑΟΧ 6
Μινώταυρος 5
ΑΕΧ 3
Ιδομενέας 2
Κρητικός Αστέρας 2
Άρης Βουκολιών 2
Γρανίτης 1
Αναγέννηση 1
Παγχανιακός 1
Ικαρος Μουρνιών 1
Κισσαμικός 1
Άρης Σούδας 1
Θησέας 1
Ακρίτας 1
Ιωνία 2000 1
Σπάθα 1
Παλαιόχωρα 1
ΣΥΝΚΑ 1
Πανακρωτηριακός 1
Απόλλων Αγ. Ιωάννη 1
ΑΕ Κυδωνίας 1