ΑΕΚ και ΠΑΟΚ έχουν βρεθεί αντίπαλοι στο Κύπελλο 22 φορές και έχουν δώσει συνολικά τριάντα αγώνες.

Έχουν παίξει 6 φορές αντίπαλοι σε τελικό και έχουν από τρεις κατακτήσεις. Η ΑΕΚ τους τρεις πρώτους, ο ΠΑΟΚ τους τρεις τελευταίους.

Στις επτά φορές που συναντήθηκαν σε ημιτελικά, ο ΠΑΟΚ έχει πέντε προκρίσεις και η ΑΕΚ δύο. Στις δύο περιπτώσεις που κληρώθηκαν στα προημιτελικά έχουν από μία πρόκριση και στις επτά φορές που έπαιξαν στη φάση των «16», ο ΠΑΟΚ κυριαρχεί με πέντε προκρίσεις.

Από το 2011, όταν η ΑΕΚ είχε αποκλείσει τον ΠΑΟΚ στην ημιτελική φάση, η ομάδα της Θεσσαλονίκης έχει κυριαρχήσει: κέρδισε τρεις τελικούς και έχει τρεις προκρίσεις σε βάρος της ΑΕΚ.

Συνολικά σε τελικούς: ΠΑΟΚ – ΑΕΚ 3-3
Συνολικές προκρίσεις: ΠΑΟΚ – ΑΕΚ 11-5