Την πρόκριση στην επόμενη φάση εξασφάλισαν οι Αλμωπός Αριδαίας, Πανσερραϊκός, Αναγέννηση Καρδίτσας και Απόλλων Πόντου.

Μετά την ολοκλήρωση και της 3ης δόσης της 3ης φάσης του Κυπέλλου Ελλάδας, οι τέσσερις τελευταίες ομάδες που εξασφάλισαν την συμμετοχή τους στην 4η φάση του θεσμού είναι ο Αλμωπός Αριδαίας, ο οποίος είχε ένα εύκολο απόγευμα νικώντας με 3-0 τον Αστέρα Σταυρού.

Ο Πανσερραϊκός κατάφερε να ισοφαρίσει το μαχητικό Αιγάλεω στις καθυστερήσεις της κανονικής διάρκειας χάρη σε γκολ του Σαΐντ, ενώ στην παράταση ανέτρεψε τα δεδομένα ο Κάνις όπου στο 108′ έβαλε σε θέση οδηγού τον Πανσερραϊκό και τον έστειλε στην επόμενη φάση.

Το Διαγόρας – Απόλλων Πόντου ολοκληρώθηκε χωρίς σκορ, ενώ το ίδιο ακριβώς συνέβη και στον έξτρα χρόνο με τις δύο ομάδες να λύνουν τις διαφορές τους στα πέναλτι με τον Απόλλων Πόντου να είναι πιο εύστοχος και να παίρνει την πρόκριση.

Τέλος, στην παράταση οδηγήθηκε και το Μακεδονικός – Αναγέννηση Καρδίτσας, με τους γηπεδούχους να παλεύουν για 90 λεπτά όμως η Αναγέννηση λυτρώθηκε στο 115′ από τον Μπάλλα.

Όλα τα αποτελέσματα της 3ης φάσης:

28/09:
Καλαμάτα-Προοδευτική 1-0
(51′ Βασιλόγιαννης)
Ηλιούπολη-Καλλιθέα 1-2
(23′ Βασιλείου / 18′ Λουκίνας, 52′ Κυνηγόπουλος)
Άγιος Νικόλαος-Επισκοπή 0-0 (4-3 στα πέναλτι)
Βέροια-Χανιά 2-1(καν. διάρκεια 1-1)
(67′ Γκουντρουμπής / 52′ Μιούλερ)
Τηλυκράτης Λευκάδας-ΟΦ Ιεράπετρας 1-1 (4-5 στα πέναλτι)
(67′ Γκουντρουμπής / 52′ Μιούλερ)
Ηρακλής-Νίκη Βόλου 0-0 (4-5 στα πέναλτι)
Απόλλων Λάρισας – Εργοτέλης 3-0 α.α.

 2/10:
Βύρων Καβάλας-Παναχαϊκή 0-5
Αλμυρός Γαζίου-Ελασσόνα 3-1
Ναυπακτιακός Αστέρας-ΑΕΛ 1-2
ΠΑΟΚ Κρηστώνης-Πανθρακικός 2-3

Τετάρτη 5/10:
Μακεδονικός-Αναγέννηση Καρδίτσας 0-1 (καν. διάρκεια 0-0)
Αιγάλεω-Πανσερραϊκός 1-2 (καν. διάρκεια 1-1)
Διαγόρας-Απόλλων Πόντου 0-0 (2-4 στα πέναλτι)
Αστέρας Σταυρού-Αλμωπός Αριδαίας 0-3

Προκρίθηκαν άνευ αγώνα στην 4η φάση:
Πανελευσινιακός
Απόλλων Παραλιμνίου
Θεσπρωτός

Τα ζευγάρια της 4ης φάσης (5/10)
ΟΦ Ιεράπετρας-Κηφισιά
Θεσπρωτός-Βέροια
Αναγέννηση Καρδίτσας-Απόλλων Πόντου
Απόλλων Λάρισας-Καλλιθέα
Νίκη Βόλου-Άγιος Νικόλαος
Αλμυρός-ΠΟ Ελλασόνας

Άνευ αγώνα θα περάσουν στην 5η φάση οι νικητές στα παρακάτω ζευγάρια:

Βύρων Καβάλας-Παναχαϊκή
Ναυπακτιακός Αστέρας-ΑΕΛ
Αιγάλεω-Πανσερραϊκός
Ιωνικός Ιωνίας/Διαγόρας Βραχνέικων
Αστήρ Σταυρού/Αλμωπός Αριδαίας
Πανελευσινιακός
Καλαμάτα
Απόλλων Παραλιμνίου

*με έντονα γράμματα οι ομάδες που πέρασαν άνευ αγώνα στην 5η φάση